create_table assemblies_parts,:id => false do |t|
  t.integer :assembly_id
  t.integer :part_id
end

如果你使用rails

rails generate model Assemblies_parts assembly:references part:references

你将有两个索引,但是你想要的是什么

# Add table index
add_index :assemblies_parts,[:assembly_id,:part_id],:unique => true

UPDATE

>对于Rails 5使用create_join_table instead.